基督教河南堂创于清光绪十六年（1890），原是位于岐兴中约的中华基督教同寅会礼拜堂，最初由美国教士巴色古牧师在河南洲头咀一带传教，光绪三十年（1904）由华人刘星南牧师主持，先后在洲头咀建同寅留产医院和学校。又在同福西路现区联合医院处办培英小学、在岐兴南办导正女子小学、在敬和里办同寅小学、在龙导尾同和里办女子识字学塾、在洪德路办福音堂。民国23年（1934）因开辟马路，同寅后礼拜堂迁移到洪德五巷建堂，民国24年4月13日新堂建成，称中华基督教洪德堂，由何少泉牧师为主任。民国27年10月日军侵占广州，占用教堂，信徒四散，教堂改作舞厅，直至民国34年抗日战争胜利，教堂才恢复宗教活动。至建国前夕，该教会所办的学校、幼儿园和医院，分别称为基英小学、幼儿园、碧基能医院。

建国后，1950——1951年，教会所属学校、医院先后由政府接管，保留洪德教堂，教堂先后由谭洲龄等牧师主持。1960年教会大联合，洪德堂为联合堂点，“文化大革命”期间，宗教活动被迫停止，教堂也被学校占用。改革开放后，落实党的宗教政策，1981年将主堂收回，同年2月22日复堂，正式称为基督教河南堂。1997年河南堂被评为“广州市文明宗教活动场所”称号。